Comme dans tous les jeux développés par Pyranha Bytes, dans Risen 2, vous aurez affaire à deux factions opposées, et suivant le camp que vous choisirez, l'histoire changera du tout au tout.

Les deux factions en question sont l'inquisition et les indigènes ("natives" en anglais). Avec l'inquisition, vous devrez sans doute utiliser des armes à feu pendant certaines missions, tandis que vous devrez faire appel au voodoo avec les indigènes. Il y a aussi une troisième faction qui est à l'écart des deux autres et vous aidera dans vos aventures : les gnomes. Ces "charmantes" bestioles vous serviront de pet et pourrons ramasser les loots pour vous, par exemple.

Vivement le 27 avril, qu'on puisse goûter aux joies de la piraterie!